Budynek Towarzystwa Naukowego w Toruniu w latach 1945-1947 był pierwszą siedzibą biblioteki, która dzieliła go razem z Książnicą Miejską im. M. Kopernika (ob. Książnica Kopernikańska). Biblioteka Uniwersytecka jako samodzielna jednostka powstała 1 września 1945 r. z 11 pracownikami (pięcioma bibliotekarzami i sześcioma woźnymi). Od tego momentu do 1 lutego 1946 r. działała, wspólnie z książnicą, pod kierownictwem dra Stefana Burhardta. 30 września 1945 r. w czytelni budynku przy ul. Wysokiej odbyło się pierwsze posiedzenie Senatu UMK.