W 1961 r., dzięki staraniom władz biblioteki, Uniwersytet otrzymał jako dzierżawę od władz miasta budynek Starego Młyna wchodzący w skład zespołu zamku krzyżackiego przy ul. Przedzamcze 6a, który oddano uniwersyteckiej książnicy na nowy, dodatkowy magazyn. Na czterech kondygnacjach zyskano 550 m2 powierzchni magazynowej. Po ponad dwuletnim remoncie i adaptacji obiektu na magazyn biblioteczny w 1964 r. przewieziono i umieszczono w nim stare druki z XVIII w. oraz ciągi czasopism i książek, głównie niemieckich. W końcu 1963 r. tuż przed przewiezieniem zbiorów do młyna odbył się tam wielki bal sylwestrowy – kostiumowy bibliotekarzy i zaprzyjaźnionych pracowników uczelni. Po przeprowadzce biblioteki w 1973 r. do nowego budynku w miasteczku uniwersyteckim na Bielanach z Przedzamcza przewieziono również te cenne zbiory. W Starym Młynie umieszczono wówczas głównie dublety biblioteczne, zbiory zabezpieczone oraz na wymianę. W magazynie znajdowało się także mieszkanie służbowe dla pracowników biblioteki.
